Själv använder jag CraftBukkit (fast just nu finns det ingen "Recomended Build" för senaste Minecraft, eftersom dom avvaktar att notch skall fixa några jättebugs i "vanilla" server'n.
CraftBukkit RB för 1.6.x kommer nog inte så länge efter 1.6.6, så jag hoppas verkligen att notch får fingret ur … örat och uppdaterar!

Värför CraftBukkit?
Deras plugin API, Bukkit, är jättebra!  Jag har själv skrivit en liten hög med plugins, och det finns tusentals att ladda ner.

Vilken serversoftware använder ni er av?